本署的環保政策綱領是:

"食物環境衞生署致力以環保方式提供各項服務，特別是收集、循環再造和減少家居廢物，節約能源和用水，以及防止空氣、噪音、水和泥土污染。本署亦在轄下各處所推廣環保內務管理。"