環境衞生
本署其中一項主要職責，是保持香港市民居住環境清潔衞生。本署在這方面提供的服務，包括清潔街道、收集垃圾、提供公廁、公眾街市和火葬場，以及管理小販。
清潔街道
本署約有4,000名潔淨工人，負責每天清掃及清洗全港街道、收集垃圾，以及管理公廁、公眾浴室和垃圾收集站。
要保持市容整潔就必須清掃街道。從清晨到晚上，都有清掃工人工作。清掃街道的次數由每天一次至八次不等，不分晝夜，視乎個別地區的需要而定。主要的商業區和旅遊地點的街道，每天約清掃四次至八次。
由二零零一年十一月開始，本署針對地區的環境衞生問題，推行多項新的清潔措施，包括調派長駐街道清潔值勤員在繁忙地點，即時清理街上的垃圾、清除非法張貼的招貼或海報，以及派遣流動潔淨隊清理衞生黑點。
除人手清掃街道外，本署的承辦商還使用機動掃街車，清潔公路、天橋、道路中央分隔欄和其他車輛來往頻繁的地區。如有需要，本署會派出特別潔淨隊清理衞生黑點。潔淨隊配備貨車、客貨車和洗街車，可隨時出動，並積極參與大規模行動，清理體積較大的棄置物品，以及清掃工人無法處理的笨重物件。如發生交通意外或天災，特別潔淨隊負責緊急的清理工作。
要保持行人道、小巷、小販區及街頭垃圾收集站清潔，就必須清洗街道。街道清洗服務除由承辦商提供外，本署亦有53輛洗街車，日夜清洗街道。各區的清洗次數各有不同，繁忙大街、街市及小販區每天清洗一次，鄉村道路則在有需要時才清洗。至於交通非常繁忙的主幹道，沖洗方法是利用高壓把水噴灑在排水明渠和中央分隔欄處。
此外，路邊的溝渠每兩星期以人手清理一次，每次清理後加入滅蚊油，以防蚊子滋生。至於高速公路和天橋上的集水溝隔，則須使用特別設備每六星期清理一次。現時，本署調配署內的八輛機動清渠車和承辦商的六輛機動清渠車，提供清渠服務，並通常在午夜過後車輛較少時，派出機動清渠車清渠。
收集垃圾
為方便市民，本署在差不多每個巴士站、主要路口、渡輪碼頭大堂、交通交匯處、地下鐵路及九廣鐵路各站出口，都設有廢屑箱，清倒的次數視乎收集量而定，由每天四次至八次不等。本署共設置18,000多個廢屑箱，還有約426個狗廁和556個狗糞收集箱，方便養狗人士。
為鼓勵市民監察本署潔淨服務員工及承辦商的工作表現，本署在廢屑箱上列明清倒次數。另外，所有新的廢屑箱上均註明熱線電話號碼2868 0000，方便市民查詢及投訴。
本署在全港各處共設有2,924個垃圾收集站，其中包括157個永久離街垃圾收集站、95個臨時垃圾收集站，814個鄉村式垃圾收集站和1,858個垃圾桶放置處。垃圾收集站有不同的設計，以配合實際需要和實地環境。垃圾收集站是用作暫時貯存街道和住戶廢物，以待收集處理。只要情況容許，本署會改善現有廢物收集服務，務求盡量減少對附近居民可能造成的滋擾。
本署從公眾垃圾收集站收集住戶廢物，每天至少一次。垃圾收集站的開放時間通常是上午七時至下午三時三十分；繁忙地區的垃圾收集站會開放至晚上十一時三十分。本署的車隊共有387輛垃圾收集車，負責把各垃圾收集站的廢物運往廢物處置地點。本署每天大約收集到5,955公噸住戶廢物，其中港島佔1,330公噸，九龍1,890公噸，新界和離島2,735公噸。本署車隊會把這些廢物運往環境保護署轄下的廢物轉運站或堆填區處理。
減少廢物
為響應政府的減少廢物綱要計劃(1998-2007)，本署已在公共地方及政府轄下場地設置1,027個物料回收站，收集廢紙、鋁罐及膠樽。本署會在新建的垃圾收集站預留地方，設置物料回收站，以便分開收集及貯存可循環再造的物料。
本署收集到的可循環再造物料日益增加，顯見廢物分類回收計劃得到市民的支持。年內，每月收集到可循環再造物料的平均重量，分別為廢紙28,496公斤、鋁罐950公斤及膠樽12,150公斤。
為配合政府推行保護環境及減少廢物的環保政策，本署已參與採用翻新輪胎試驗計劃。這項計劃不但減少棄置舊輪胎的數目和減輕車輛的維修成本，更能達到減少廢物的目的。本署初期只選擇垃圾收集車試用翻新輪胎，如試驗成功，便會把計劃推廣至其他類別的車輛。
公廁及公眾浴室
為了改善現有的公廁設施，本署展開公廁翻新計劃。年內，已改善了35個公廁(27個在市區，八個在新界)的設施。本署會繼續提高公廁的衞生、安全和舒適水平。現時所有公廁均有免費廁紙供應。
公廁主要設在渡輪碼頭大堂、巴士總站、郊遊地點、旅遊點及其他繁忙地區。由本署負責管理的公廁共有306個，其中99個在港島，67個在九龍，140個在新界及離島。此外，另有569個化糞式廁所設在新界和離島。
本港一些舊區現時仍有設備不合標準的住宅樓宇。本署在這些地區共設置33個公眾浴室，其中10個在港島，13個在九龍，10個在新界及離島。
環境衞生滋擾
如有冷氣機滴水、垃圾堆積，以及因排水管損壞而引致樓宇滲水等環境衞生滋擾，本署會向有關人士發出勸誡信和法定妨擾事故通知。
違反清潔法例的行為
本署所有衞生督察、管工及小販管理職系人員，均獲授權向違反清潔法例人士發出傳票。除了日常的執法行動外，本署亦採取突擊行動檢舉垃圾蟲。年內，本署向違反清潔法例的人士發出10,680張傳票，罰款總額為696萬元。法庭判處的罰款平均為每宗個案652元。
立法會於二零零一年七月十二日通過《定額罰款(公眾地方潔淨罪行)條例草案》。新法例訂明在公眾地方亂拋垃圾、隨地吐痰、未經准許而展示招貼或海報，以及讓狗糞弄污公眾地方均屬違例罪行。違例人士會被判定額罰款600元。年內，本署共發出8,934張定額罰款通知書。
小販管理
為貫徹執行減少街頭販賣活動的政策，本署已停止簽發新的小販牌照，並遷置合資格的持牌小販在公眾街市和熟食中心／市場經營。此外，本署又向小販提供優惠，鼓勵他們放棄牌照或遷入上述場所經營。這些措施實施後，持牌小販(包括固定攤位小販和流動小販)人數在二零零二年年底已減至8,575名。
年內，共有33名流動小販自願交回牌照，以換取三萬元特惠金或一個空置的固定攤位經營權，或以優惠租金租用一個街市檔位。此外，一名熟食檔經營者根據本署持續推行的購回小販牌照計劃自願交回牌照，以換取六萬元特惠金。
管理和管制小販的任務，由一支受過訓練的隊伍負責。這支隊伍約有2,500人，編為194支小販事務隊，支援設施包括控制中心和撿獲貨物倉庫。如有需要，警署內會設立小販處理中心，方便辦理檢控被捕小販的手續。
環境衞生人員定期巡視固定攤位，確保小販遵守持牌條件和相關法例。他們又負責管理在街上販賣的流動小販，如有需要，會採取執法行動，遏止違例情況。二零零二年，被定罪的個案共有2,084宗。
鑒於當前的經濟狀況，本署修訂了對街頭販賣活動的執法策略，自二零零一年十二月起，對售賣非食物類乾貨的小販採取較容忍的態度。
公眾街市及熟食中心／市場
公眾街市及熟食中心／市場的設立，對改善香港整體環境極為重要。本港現時有82個公眾街市，共15,103個檔位，售賣各種貨品，由新鮮食物以至家居用品都有。此外，本港還有38個熟食中心和24個獨立熟食市場，共1,048個檔位。在二零零二年七月，北區一個新街市正式啟用，另有四個街市現正興建或籌劃興建中。
所有公眾街市攤檔均以競投方式租出，檔戶須與本署簽訂租約。根據現行政策，大部分檔戶享有租金減免優惠。
本署現正在花園街街市、紅磡街市、北葵涌街市和士美非路街市推行街市經理試驗計劃。計劃的主旨是從私營機構聘請資歷較高並在專業管理方面有較多經驗的人士，專責管理公眾街市，從而為公眾街市的管理注入新意念和新構思，以便日後評估公眾街市管理工作能否進一步改善。
本署街市職員每天會巡視街市的所有檔位，確保檔戶遵守租約條文及有關法例。衞生督察則會定期巡查肉食、家禽、鮮魚和熟食檔，確保食物衞生及檔戶遵守相關的衞生守則和法例，保持食物清潔衞生。如有需要，他們會向違例人士採取執法行動。在二零零二年，被定罪的個案共1,509宗。
墳場及火葬場
本署轄下的六個火葬場和11個公眾墳場，提供有效率及莊嚴得體的火葬及土葬服務。此外，本署還管理28個私營墳場，並監察其運作。政府鼓勵市民採用火葬而不選擇土葬。年內，本署為28,434名死者(佔死亡人數82.9%)提供火葬服務。八個紀念花園設有137,939個靈灰龕，本署以合理價格售予市民安放骨灰。
在公眾墳場土葬的遺骸，必須於六年後撿拾，然後火化或重葬於金塔墳場。鑑於紅磡市立殯儀館的使用率偏低，而市民對私人殯儀館的需求較高，本署已於二零零二年年初，把紅磡殯儀館的殯葬服務外判。
由於本港人口老化，以及市民對火葬服務的需求不斷增加，本署現正計劃改善火葬設施。
新設施
本署已獲得撥款，用以更換葵涌火葬場的四個火化爐。新的火化爐將於二零零三年年初投入服務。
為了提高服務效率，並盡量減少火葬設施對環境的影響，只要情況許可，本署會興建可增加火化量和縮短火化時間，但不會影響環境的火葬設施。本署現正積極計劃更換富山火葬場和鑽石山火葬場的火化爐。
本署亦計劃分期改善火葬場的儀式禮堂。歌連臣角火葬場西式禮堂的翻新工程將於二零零三年展開。
本署轄下有六個公眾火葬場：歌連臣角火葬場、鑽石山火葬場、富山火葬場、和合石火葬場、葵涌火葬場和長洲火葬場。為方便市民預訂公眾火葬場的火化時段，本署於灣仔胡忠大廈和九龍長沙灣政府合署設有預訂辦事處，市民可親自前往辦理預訂手續。