食物環境衞生署致力以環保方式提供各項服務，特別是收集、循環再造和減少家居廢物，節約能源和用水，以及防止空氣、噪音、水和泥土污染。本署亦推廣綠色殯葬，作為可持續採用的骨灰處理方法，並在轄下各處所推廣環保內務管理。