食物环境卫生署是香港食物业及一些行业的发牌当局。
发牌工作
食肆、食物制造厂、新鲜粮食店、烘制麪包饼食店、工厂食堂、烧味及卤味店、冰冻甜点制造厂、奶品厂和冻房均须向本署申领牌照。本署又签发许可证给某类店铺，以供售卖限制出售的食物，如冰冻甜点、奶类、非瓶装饮料、凉茶、切开售卖的水果、寿司及刺身、不经烹煮而食用的蠔和肉类，以及售卖机出售的食物等。食肆内的卡拉OK场所亦由本署签发许可证。
食物业处所须符合有关部门所订的安全及卫生标准，才会获发牌照。
剧院、戏院和娱乐游戏机中心等公众娱乐场所，以及商营浴室、私家泳池、殡仪馆、殓葬商、屠房和厌恶性行业均须申领行业牌照。
暂准牌照
为方便食物业尽早开业，本署推行暂准牌照制度。根据这个制度，申请牌照的处所如符合各项有关卫生、楼宇安全和消防安全的基本规定，会获发暂准食物业牌照，有效期为六个月。在这段期间内，持牌人须履行所有尚未遵行的规定，才会获发正式牌照。
2007年，本署共接获2,922宗暂准食物业牌照的申请，并发出1,976个暂准牌照。牌照申请人如符合所有基本的发牌规定，可于一个工作天内在牌照签发办事处领取暂准牌照。
已处理的牌照申请及签发的牌照
年内，本署共接获和处理3,058宗食物业牌照申请(包括1,619宗食肆牌照申请)。此外，还有1,209宗售卖限制出售食物许可证申请、1 098宗公众娱乐场所牌照申请及37宗其他行业牌照申请。本署设有三个牌照办事处，分别位于港岛、九龙和新界，负责处理牌照申请。
本署亦发牌予一间戏院、11间娱乐游戏机中心、一间商营浴室和30个私家泳池。
签发酒牌
凡售卖酒类饮品以供在处所内饮用都必须领有由独立法定机构酒牌局签发的酒牌。
酒牌局通常每星期举行一次会议，处理有争议的申请个案。该局行使法定权力，定期检讨有关签发酒牌和监管领有酒牌处所的政策。本署人员为酒牌局提供行政及文书服务。
年内，酒牌局接获854宗酒牌及会社酒牌申请，并签发了838个新牌照。此外，共有4,921个酒牌及会社酒牌获准续期。
酒牌局定期举办酒牌事务研讨会，以便申请人和持牌人了解本身的法律责任和妥善管理其处所的责任。年内，该局举办了12个研讨会，共有604名酒牌申请人及持牌人参加。
巡查工作
卫生督察定期巡查持牌食物业处所，以确保这些处所遵守发牌及持牌条件，并符合法例订明的卫生标准。除日常巡查外，高级人员还进行督导巡查。此外，他们又会定期巡查获发行业牌照的处所，例如戏院、商营浴室及私家泳池。
本署采用以风险评估为本的巡查制度，规管持牌食物业处所。本署会根据持牌食物业处所的风险类别和卫生水平，订定巡查次数。此外，巡查时除进行一般的卫生检查外，还着重食物安全检查，以及提供卫生教育。
执法工作
食物业经营者如违反公众卫生法例，会被检控。本署推行违例记分制，一再违例者可能会被暂时吊销或取消牌照。此外，根据警告信制度，多次违反发牌或持牌条件者可能会被取消牌照。
此外，本署采取严厉措施，对付无牌食物业处所，包括检控违例者和即时拘捕屡犯者。
《公众卫生及市政条例》提供有效的机制，当局可以着令封闭对市民健康构成即时危害的食物业处所。年内，本署署长行使法定权力，向鱼缸水样本验出致病性霍乱弧菌的处所和涉及食物中毒事故的处所发出七份封闭令。
2007年对持牌及无牌食物业处所采取执法行动的统计数字
| 持牌食物业处所 | |
|---|---|
| 持牌食物业处所数目 | 19,577个 |
| 巡查数目 | 205,549次 |
| 检控数目 | 4,204宗 |
| 暂时吊销牌照数目 | 160个 |
| 取消牌照数目 | 6个 |
| 无牌食物业处所 | |
| 检控数目 | 2,065宗 |
| 封闭食物业处所 | |
| 发出封闭令数目 | 7份 |
卫生经理／卫生督导员计划
实施卫生经理／卫生督导员计划的目的，是促进食物业处所加强食物安全的监督工作。根据计划，所有大型食店／食物工场及制造高风险食物的食店／食物工场都必须委任卫生经理及卫生督导员各一名，其他食店／食物工场则须委任一名卫生经理或卫生督导员。本港多间院校和职业训练中心提供本署认可的卫生经理／卫生督导员课程。卫生经理培训课程的修读时间约16至20小时，卫生督导员培训课程则约六小时。自2001年12月起，本署为持牌食物业处所负责督导工作的员工提供免费的卫生督导员培训课程。截至2007年年底，本署开办了合共1,195个卫生督导员课程，培训了53,813名卫生督导员，各院校和训练中心则培训了18,432名卫生经理。
屠房
香港的鲜肉(即牛肉、猪肉和羊肉)是由三间分别位于上水、荃湾及长洲的屠房供应。本署除监管持牌屠房的运作，确保其环境及卫生标准符合规定外，还打击非法屠宰活动。
为保障市民健康，由持牌屠房屠宰的食用牲口在屠宰前后均须接受检验，确保适宜供人食用，才可运往市场售卖。年内，本署对怀疑是非法屠房的处所，采取了305次扫荡行动和监察巡查。本署亦对新鲜粮食店和街市肉档进行了7,761次突击巡查，以防贩商售卖由非认可来源提供的肉类。
本署亦密切监察把进口冰鲜肉类当作新鲜肉类出售的不当行为，年内共吊销三个新鲜粮食店牌照和终止两份街市摊档租约。
