行政及發展部為本署提供各項管理及支援服務。
職系管理
衞生督察職系、小販管理主任職系及管工職系是本署三個主要職系。兩名職系經理分別負責管理衞生督察職系和小販管理主任及管工職系人員，他們的工作涵蓋人力策劃、職業前途發展、職位調派、員工晉升及培訓等範疇。
衞生督察負責執行有關環境衞生及食物安全的職務，例如處理環境滋擾個案、在食物業處所進行衞生巡查、發牌、檢控、肉類檢驗、潔淨服務、服務外批、防治蟲鼠、小販管理、街市管理、墳場及火葬場管理、規管私營骨灰安置所、食物管制及衞生教育。
小販管理主任負責規管街上擺賣活動、管理小販認可區，以及對非法擺賣活動採取執法行動。他們也負責檢控干犯潔淨罪行的人，例如亂拋垃圾和隨地吐痰者。
管工主要負責督導前線人員執行街道潔淨、廢物收集、防治蟲鼠，以及墳場、火葬場和街市管理工作。他們也負責車輛事務，以及監察本署承辦商的服務表現，同時對干犯潔淨罪行的人採取法律行動，予以檢控。
員工培訓
本署推行員工培訓及發展工作，旨在提升個人和部門表現，為市民提供優質服務。這些培訓及發展項目為員工提供發展領導才能的機會，配合部門的新措施提供所需訓練，並發掘個人長處以令員工更專業地服務市民。此外，本署還提供加深員工安全意識的職業安全及健康的培訓及發展項目。
除了由署內人員擔任導師外，我們亦會邀請不同範疇的專家提供培訓，讓員工掌握相關範疇的最新發展，與時並進。本署的培訓課程主要在本地舉辦，另外也會提名員工到海外受訓。
二零一九年，本署開辦了629個課程，為12,564名人員提供合共38,077日的培訓，包括為549名新聘人員舉辦入職訓練課程，使他們具備執行職務所需的知識與技能。本署又批准九項資助申請，讓員工在公餘時間修讀與職務相關的課程，並安排19名員工修讀14個外地培訓課程，這些課程為員工提供合共196日的培訓。
管理參議
管理參議、調查及統計組的工作主要包括管理諮詢和統計服務，協助部門提高公共服務水平、監察服務表現水準、制訂提供服務及員工管理的政策。該組持續提供諮詢服務，協助部門實施各項研究的建議，以及提供技術意見，協助部門進行統計調查和分析所得數據。年內，該組完成了五項管理研究和兩項統計調查。
財務管理
財務及物料供應科負責處理所有開支和採購事宜，包括支付款項、提供財務意見和進行監管。
二零一九年，本署的開支總額為80.29億元，其中薪金和津貼及與員工有關連的開支佔39.13億元，部門開支及其他費用佔38.88億元，而非經營及非經常開支則佔2.28億元。
按工作性質分類，大部分開支用於提供環境衞生服務（39.83億元），其餘依次為街市及小販管理（18.80億元）、食物安全及公共衞生（12.68億元）、行政及發展（4.36億元）、食物業監管（3.84億元）、公眾教育及市民參與計劃（7,800萬元）。
年內，本署的收入為8.27億元，其中大部分來自轄下公眾街市攤檔的租金（3.56億元），以及簽發牌照和許可證的收費（1.87億元）。其他收入來源包括法庭罰款和法定罰款（8,200萬元）、屠房及其他特許經營權的收費（8,100萬元）、墳場和火葬場服務收費（7,900萬元）、肉類檢驗費（1,400萬元），以及其他雜項服務收費（2,800萬元）。
建設工程
在二零一九年政府基本工程計劃資源分配工作中，食物和環境衞生服務建設工程的五年撥款估計為37.23億元。該筆撥款用以支付本署的工程開支。
垃圾收集站
為改善香港的居住環境，本署繼續在設有現代化除臭裝置的密封式建築物提供離街垃圾收集設施，以取代路旁的臨時垃圾收集站。
本署已於二零一九年完成在啟德發展區IJ4工地興建一個新垃圾收集站的工程，並在一個住宅發展項目內原址重置營盤街臨時垃圾收集站。此外，本署會於二零二零年在一個商業發展項目內原址重置永康街臨時垃圾收集站，以及把上海街臨時垃圾收集站重置至巧翔街，並於二零二一年重置協和街／同仁街臨時垃圾收集站。
公廁
二零一九至二零年度的《財政預算案》公布政府會預留約六億元，在未來五個財政年度（即二零一九至二零年度至二零二三至二四年度）分階段為約240個本署管理的公廁展開翻新或優化工程，以改善公廁的設施和提高公廁的清潔衞生水平。年內，49個公廁完成翻新／優化工程，包括在主要旅遊景點的15個公廁。另有114項工程正在進行或處於籌劃階段。
公眾街市及熟食中心
政府現正進行七個處於不同規劃階段的新街市項目，包括在天水圍、東涌市中心、將軍澳、古洞北新發展區、東涌新市鎮擴展區和洪水橋新發展區興建新公眾街市，以及在天水圍設立臨時街市。政府會考慮在這些項目的設計、建造和營運方面採用新的模式。本署正與相關部門合作推展這些新街市項目，為市民購買新鮮糧食提供更多選擇。為了盡量縮短天水圍臨時街市的施工期，街市正以「組裝合成」的方式建造。視乎實際進度，預計臨時街市可於二零二零年年底完工啟用。
除了興建新公眾街市之外，政府已預留20億元推行為期十年的「街市現代化計劃」（現代化計劃），為公眾街市進行各類硬件改善工程，目標是提升公眾街市的營運環境，惠及市民大眾及租戶。本署正全力推行現代化計劃，首個項目為全面翻新香港仔街市。本署同時計劃全面翻新另外三個公眾街市，以及為全港多區共約10個公眾街市開展小型翻新或改善工程。
此外，政府一直推展措施以改善公眾街市的經營環境，包括在適當情況下更換老化的升降機和扶手電梯、改善通風與照明系統和消防設備，以及翻新外牆和廁所等。為確保公眾街市的升降機和扶手電梯操作暢順，政府分階段更換舊式升降機和扶手電梯，至今已預留4.45億元，為33個公眾街市更換53部升降機和125道扶手電梯。
墳場、火葬場及骨灰安置所
政府現正探討各種可行方法，以增加公眾骨灰安置所設施，包括推動地區為本的骨灰安置所發展計劃，並在現有墳場和骨灰安置所增設骨灰龕位。政府已物色可供發展骨灰安置所的用地，本署已就其中14個項目取得相關區議會的支持，涉及約590,000個新骨灰龕位，約佔規劃總數的三分之二。政府會加快在上述選址發展公眾骨灰安置所，以應付日益增加的需求。
坪洲靈灰安置所增建的360個骨灰龕位和長洲靈灰安置所增建的670個骨灰龕位分別於二零一八年及二零一九年落成。位於黃泥涌道的骨灰安置所建造工程已於二零一九年完成，提供855個骨灰龕位，而位於屯門的曾咀骨灰安置所設施在二零一九年起分階段提供約共160,000個骨灰龕位。其他正在進行的工程包括和合石墳場興建骨灰安置所設施工程第一期（在二零二零年起分階段提供約44,000個骨灰龕位）、歌連臣角道骨灰安置所設施工程（在二零二二年起分階段提供約25,000個骨灰龕位），以及沙嶺墳場骨灰安置所的土地平整及相關基礎設施工程。另外，本署正擴建長洲靈灰安置所（在二零二零年額外提供約580個骨灰龕位）。
為應付市民對火化服務的需求，本署會在和合石火葬場增建兩個遺體火化爐和一個禮堂，工程將在二零二三年完成。
外批服務
外批服務的目的，是提高服務的成本效益和靈活性。截至二零一九年年底，本署與私人承辦商簽訂了169份服務合約，總金額為69.851億元，有關的分項數字如下：
| 外批服務種類 | 合約數目（份） | 合約金額（元） | 佔外批服務合約總值（%） |
|---|---|---|---|
| 街道潔淨（包括公廁潔淨） | 34 | 34.511億元 | 49.41% |
| 廢物收集 | 16 | 10.589億元 | 15.16% |
| 街市／小販市場潔淨 | 7 | 1.766億元 | 2.53% |
| 街市管理及有關服務 | 14 | 2.586億元 | 3.70% |
| 市政大廈潔淨 | 12 | 4,910萬元 | 0.70% |
| 保安員 | 23 | 2.549億元 | 3.65% |
| 防治蟲鼠 | 19 | 8.922億元 | 12.77% |
| 其他 | 44 | 8.437億元 | 12.08% |
批給私人承辦商負責的服務包括街道潔淨、廢物收集、街市／小販市場潔淨、街市管理及有關服務、市政大廈潔淨、提供保安員、防治蟲鼠、機械清掃街道、機械清洗街道、機械清渠、回收可循環再造物料、收集動物屍體、墳場和骨灰安置所的潔淨及園藝保養、樹木風險評估及樹藝服務等。
本署的合約訂明可量度的服務表現標準，確保承辦商的服務質素良好，同時載有關於勞工保護和職業安全的條款，以保障非技術工人的權益和促進他們的福祉。本署人員除每天審閱相關紀錄外，還進行突擊實地巡查，以確保承辦商時刻遵守合約規定。
按照行政長官於二零一八年十月公佈的措施，本署在二零一九年四月一日或以後招標的服務已採取以下的改善措施，以保障外判服務承辦商聘用的非技術工人：
- 評分制度下技術審核的比重由30%增至50%；
- 技術審核中工資水平的比重增至100分中佔25分(25%)；
- 按連續性合約受僱不少於1年的非技術工人，在僱傭合約屆滿或終止聘任（不包括即時解僱作為嚴重紀律處分）時，以所獲發工資總額的6%作為合約酬金；
- 按連續性合約受僱不少於1個月的非技術工人，會獲發放法定假日薪酬；以及
- 非技術工人如須在8號或以上颱風信號生效時工作，則該日／更次的工資額應為有關工人原本享有工資的至少150%。
投訴管理
投訴管理組負責制訂和檢討有關處理各類投訴的政策及程序。二零一九年，本署共收到221,910宗市民要求提供服務或作出投訴的個案。
服務質素檢定
本署的其中一項首要工作是不斷改善服務質素，確保為市民提供優質服務。
服務質素檢定組的主要目標是監察和改善本署的服務質素。為達到這個目標，該組人員日常檢查由本署及服務承辦商提供的各項服務，如發現現行工作制度、程序及指引有不足之處，便會提出改善建議。為表揚表現優異、工作勤奮的前線人員，服務質素檢定組會提名表現出色的員工領受服務質素檢定獎和員工嘉許狀。此外，該組以獨立、客觀和公正的方式，調查員工在工作上行為失當的個案和服務承辦商違反僱傭規定的投訴。服務質素檢定組又會進行審核檢查和與僱傭規定有關的檢查，以核實服務承辦商有否履行與僱傭有關的承諾。
公眾教育及宣傳
公眾教育在確保食物安全、改善環境衞生和推廣綠色殯葬作為一種可持續方式處理先人骨灰方面，都是不可或缺的一環。為推行公眾教育，本署舉辦宣傳及教育活動，包括講座、展覽和外展計劃，以提高市民對該些課題的認識。
本署在九龍公園內設立衞生教育展覽及資料中心，為學校、老人中心、其他非政府機構及市民安排團體參觀及導覽活動，亦會定期舉辦講座和外展活動。為維持中心對公眾的吸引力及增加訪客人數，本署不時改善中心的設施和更新展板。二零一九年，本署為中心進行外牆維修工程和屋頂防水層修復工程，以保育這幢文物建築，並翻新介紹本署工作及講解使用公廁正確守則和不同廁所標誌的展板，以及翻新在中心展示的＂平安小姐＂、 ＂清潔小姐＂和 ＂清潔龍＂卡通塑像。年內，參觀中心的訪客達78,404人次。中心為幼稚園及中小學舉辦了983場講座和活動，而為老人中心和市民舉辦的講座則分別有765場和369場。此外，流動教育中心（一輛宣傳車）以外展形式推廣衞生教育，往訪學校、屋邨及公園達209次。
食安中心轄下設有傳達資源小組，因應市民和食物業界的需要，向他們傳達食物安全風險資訊。該小組的辦事處設於欽州西街本署南昌辦事處暨車房，提供有關推廣食物安全的資料，並附設配備視聽設施的展覽廳和資料角。小組接受學校、社區中心和有興趣的市民預約參觀或參加食物安全講座，以及申請借用教材、展板和視聽資料。除支援食物安全風險傳達的工作和活動外，小組還定期舉辦多項教育活動。年內，小組舉辦了181場研討會、工作坊和不同類別的宣傳活動，當中包括食物安全巡迴展覽，對象是市民和選定的目標群體，包括食物處理人員、學生、長者和少數族裔人士。
二零一九年，本署繼續通過電視和電台政府宣傳短片和聲帶、Facebook、Instagram和YouTube等社交媒體、流動應用程式、橫額、海報、小冊子和單張，進行有關環境衞生、食物安全和綠色殯葬的宣傳工作。本署透過清潔龍阿德的Facebook和Instagram專頁，以及讓清潔龍阿德在公眾場合及社區活動中亮相，宣傳個人、家居和環境衞生的信息，並呼籲市民合作和支持清潔香港的工作。此外，本署亦舉辦滅鼠運動和滅蚊運動，推動市民支持和參與防治蟲鼠工作，同時協助非政府機構進行清潔活動／工作。
本署在二零一八年成立了一支專責隊伍，加強推廣綠色殯葬，令市民接受以綠色殯葬這種可持續方式處理先人骨灰，包括在紀念花園或在海上撒放骨灰。除了老人中心／安老院舍外，該隊伍亦為大專院校、醫院、教堂、公共圖書館、分區委員會和區議會舉辦綠色殯葬講座。此外，專責隊伍與非政府機構合作，在該等機構的宣傳活動中就生死議題／生涯規劃議題主持講座或設置宣傳攤位，並安排參觀紀念花園或出海觀看海上撒灰的活動。本署定期在公共屋邨、公眾街市和公園舉辦巡迴展覽，透過播放影片及派發單張和紀念品，宣傳綠色殯葬的信息。二零一九年，該隊伍合共安排了337項各類型的宣傳活動。