本署設有三個事務部，即環境衞生部、食物及公共衞生部和行政及發展部。

本署運作或會對環境造成影響，有關概況如下：

環境衞生服務

本署致力為香港市民提供和保持清潔衞生的居住環境。本署提供的環境衞生服務包括公共潔淨服務、食物業的發牌及管制、提供和管理環境衞生設施，以及小販管理。

公共潔淨服務

本署致力保持公共地方清潔和整潔。直接的公共潔淨服務包括清掃及清洗街道、收集住戶廢物和街頭垃圾、清渠、清糞，以至管理潔淨設施如垃圾收集站等。這些服務由本署4 000名潔淨人員及本署委聘的私人承辦商提供，他們的服務由本署緊密監管。

本署在全港提供逾18 000個廢屑箱和556個狗糞收集箱，另在全港各處共設有2 924個垃圾收集站，用作暫時貯存街道和住戶廢物，以待收集處理。本署每天至少一次從垃圾收集站收集住戶廢物，而由本署直接管理或由承辦商管理的垃圾車每日收集約5 955公噸廢物。

食物業的發牌及管制

本署發牌監管食物業，以保障市民的健康和安全，又定期巡查，確保持牌食物業處所符合衞生標準，並對衞生欠佳的食物業處所採取執法行動，例如檢控、即時拘控、施行法令、每日罰款，以及暫時吊銷或取消牌照等。

提供和管理環境衞生設施

本署負責管理多種環境衞生設施，供市民使用。本署共管理38個熟食中心、24個獨立式熟食市場、81個公眾街市、306個公廁、33個公眾浴室、11個公眾墳場、六個火葬場和八個紀念花園。為配合本署為香港市民提供清潔衞生居住環境的承諾，如資源許可，本署會按需要作出改善及提高這些設施的質素。

小販管理

街頭擺賣是由來已久的社會經濟活動，亦是本港的生活方式之一。透過發牌制度和執法行動，本署希望盡量減少街頭擺賣活動所造成的滋擾。

食物及公共衞生服務

本署監察進口食物及本地生產食物的安全，以確保供人類食用的食物有益健康、不含雜質，並附有適當標籤。本署亦透過檢驗和管制食用牲口，保障市民健康；此外，又致力預防由傳病媒介傳播的疾病，並就保持食物和環境衞生的正確方法，向市民提供意見。對環境有影響的主要工作範疇包括食物監察與驗證、風險評估與傳達，以及防治蟲鼠等工作。

食物監察及驗證

本署持續監察和測試食物，並採取執法行動，以確保供應本港的食物可供安全食用。本署在進口、批發及零售地點抽取食物樣本，進行化學、微生物、輻射及毒性測試，以確保這些食物適合人類食用。本署並檢查預先包裝的食物是否符合食物標籤法例的規定。

風險評估及傳達

本署就食物安全進行風險評估，釐定食物安全標準，並建議食物安全管制的措施。在風險傳達方面，本署引入並推行食物安全重點控制系統，以確保食物安全，並定期向市民和食物業人士提供食物安全資訊。

防治蟲鼠

本署向政府部門及市民提供防治蟲鼠的意見。本署的工作包括監察及監控蟲鼠問題，以防止由傳病媒介傳播的疾病在本港蔓延，並調查發病事件。分區防治蟲鼠組負責執行防治蟲鼠的工作。

行政及發展服務

建設工程計劃

本署負責策劃新建設工程及部門現有設施(例如街市、垃圾收集站、公共廁所及火葬場)的小型改善工程。本署在策劃時，會繼續盡量減輕這些工程在施工及投入服務階段對環境所造成的影響，並會引入環保設施，盡量減少負面的環境影響。

公眾教育及運動

本署在尖沙咀設有衞生教育展覽及資料中心，藉此舉辦多項宣傳及教育活動，並舉行展覽、外展計劃和研討會，作為本署同時推廣食物安全和環境衞生的其中一環。提高環保意識亦包括在這些活動內。此外，本署又主導舉辦"清潔香港計劃"，改善香港的環境衞生情況。